飞诺美色谱柱是高效液相分离系统的中重要的环节，业内常把色谱柱比喻为液相色谱的心脏，其根据极性分为正相柱和反相柱。正相柱大多以硅胶为主，反相柱填料主要以硅胶为基质。
在使用飞诺美色谱柱的过程中应当注意的问题：
1、避免直接改变溶剂的组成
在需要改变检测样品溶液组成是，应逐渐改变溶剂的组成，特别是反相色谱中，不应直接从有机溶剂改变为全部是水，反之亦然。且在使用次洗脱能力强的 洗脱液冲洗时，对流路系统中流动相的置换应以相混溶的溶剂逐渐过渡，每种流动相的体积应是柱体积的20倍左右，即常规分析需要50~75ml。
2、避免压力和温度的急剧变化
温度的突然变化或者使飞诺美色谱柱从高处掉下都会影响柱内的填充状况；柱压的突然升高或降低也会冲动柱内填料，因此在调节流速时应该缓慢进行，以保持柱内填料的稳定性。
3、避免色谱柱反冲
一般来说不能反冲，只有使用说明书上标明该柱可反冲才可以反冲除去留在柱头上的杂质。否则，会影响是迅速降低柱效。
4、禁止样品未经处理直接进入
避免将基质复杂的样品尤其是生物样品直接注入柱内，需要对样品进行预处理或者在进样器和色谱柱之间连接一保护柱。保护柱一般是填有相似固定相的短柱，保护柱可以而且应该经常更换。
5、避免流动相使用不当而破坏固定相
选择使用适宜的流动相（尤其是pH），以避免固定相被破坏。有时可以在进样器前面连接一段预柱，分析柱是键合硅胶时，预柱为硅胶，可使流动相在进入分析柱之前预先被硅胶"饱和"，避免分析柱中的硅胶基质被溶解。
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